Applied Biosystems™ Protein Thermal Shift™ Software v1.4

Descripción

Las diferentes proteínas tendrán diferentes perfiles de Protein Thermal Shift™, cada uno con una forma de curva de fusión de proteínas, una pendiente, una relación señal-ruido y un rango de fusión de temperatura únicos (consulte la figura siguiente para ver un ejemplo). El software Protein Thermal Shift™ genera uno o varios valores de temperatura de fusión (Tm) a partir de estas curvas mediante dos métodos: la Tm derivada de Boltzmann y la Tm determinada por curva derivada, para servir como puntos de comparación entre las curvas y representar la estabilidad térmica relativa de la proteína en diferentes condiciones de ensayo.

Dos métodos para generar el valor Tm
El método Boltzmann ajusta los datos dentro de una región de fusión identificada automática (o manual) al modelo Boltzmann de dos estados para generar la Tm. Típicamente, para las proteínas con un solo dominio de fusión, se utiliza el método Boltzmann. Sin embargo, para las proteínas con múltiples dominios de fusión, se puede utilizar el método de curva derivada. El método de curva derivada utiliza una segunda derivada calculada numéricamente de los datos en bruto para estimar las temperaturas en las que pueden producirse hasta seis picos (máximos locales) en el perfil de derivadas. Se utiliza un umbral empírico en la relación señal-ruido para determinar qué máximos locales se detectarán.

Compatible con nuestros sistemas de PCR en tiempo real
El software de análisis Protein Thermal Shift™ es compatible con los archivos de procesado generados a partir de estos sistemas de PCR en tiempo real: QuantStudioTM 3, 5, 6, 6 Pro, 7, 7 Pro y 12K Flex, StepOne™, StepOnePlus™, 7500, 7500 Fast y Viia™7.

Prepare sus muestras con nuestros kits Protein Thermal Shift™
Prepare sus muestras para el análisis con nuestro kit de inicio Protein Thermal Shift™ o el kit de tinción Protein Thermal Shift™ (disponible por separado). Estos kits permiten a los usuarios emplear un colorante que se une a los residuos hidrófobos expuestos para controlar la estabilidad térmica de las proteínas utilizando un instrumento de PCR en tiempo real para identificar las condiciones de tampón que estabilizan la proteína de interés o detectar bibliotecas de ligandos para compuestos que se unen a la proteína de interés.